RAPTOR

Раптор є інноваційна програма, розроблена для точного передбачення структури білка. Вона поєднує в собі передові інструменти аналізу в одному інтегрованому програмному рішенні і надає три різних методи потокової. Унікальне ціле число, програмування оптимізація підхід Раптора є найбільш ефективним для знаходження шаблонів структури мішеней з низьким гомології послідовності і здатний генерувати моделі високої якості. Простий у використанні інтерфейс і проста для розуміння значення E ідеально підходять для новачків та експертів. Перш за все, інтуїтивно зрозумілий дисплей на виході дозволяє користувачам зрозуміти результати просто на перший погляд. Враховуючи послідовність білка мішені, якщо є гомологічний білок з відомою структурою 3D, вона може бути знайдена за допомогою пошуку послідовності інструменти, як PSI-BLAST, також представленої в Raptor. Структура мети потім побудували з відомої структури; Однак, коли гомологія не є суттєвим, тобто менше 25%, PSI-BLAST не може придумати впевненою хіт. На відміну від PSI-BLAST, який просто робить пошук послідовність білка, різьблення, скласти визнання, робить використання як гомології і структура інформації. Вона сканує послідовність білка з невідомою структурою з базою даних відомих структур. При використанні функції підрахунку очок і проведення аналізу сумісності між тривимірних структур і лінійних білкових послідовностей, кращий структурного шаблону будуть визначені, з яких побудувати структуру послідовності в. В результаті, білок різьблення дає чудову прогноз, ніж гомологий моделювання, коли є гранична гомології послідовності

Обмеження :.

Обмежена функціональність